電動自行車運用的電池種類有鋰離子電池、聚合物鋰離子電池、鎳氫電池、鎳鎘電池、鋅空電池、燃料動力電池等。

1、鋰離子電池：鋰離子電池的比容要好于鎳氫電池，有關相同容量的鉛酸蓄電池來說，鋰離子電池的分量相當于一臺筆記本電腦，這樣老弱婦孺就都能夠運用了。其壽數也能夠比鎳氫電池做得好。

當前的手機電池基本上都是選用這種電池。鋰離子電池的內阻相比照較大，在電動自行車上運用會呈現電池行將徹底放電的時分感受車的動力缺乏。鋰離子電池更首要的疑問是在過充電和過放電狀況電池會發生爆破，手機電池都是運用的單體電池，再通過杰出的維護電路來合作使用，基本上杜絕了電池爆破的疑問。

而在電動自行車上運用，有必要要運用串連電池組，而串連電池組的維護電路的雜亂程度遠遠超越單體電池的維護電路，其資料成本也大大添加。當前一個杰出的鋰離子電池維護電路的本錢挨近電池自身的報價。

2、聚合物鋰離子電池：聚合物鋰離子電池的爆破殺傷力低于鋰離子電池。可是，也存在著爆破和焚燒的可能性。這也是與鋰離子電池相同需求解決疑問的。

3、鉛酸蓄電池：鉛酸蓄電池為數量最多。鉛酸蓄電池的報價最低，也最常用，我國是全世界鉛酸蓄電池最大的出產國。其含污染的成分比較少，可收回性好。缺陷是比容小。也就是說，在相同的容量下，電池分量和體積都大。當前的鉛酸蓄電池基本上是由浮充類型的電池展開而來的。浮充電池不適應疾速充電和大電流放電，盡管技術人員的花費了許多的汗水進行了行之有效的改善，能夠進入實用了，可是其壽數仍是十分不抱負的。

4、鎳氫電池：鎳氫電池的比容比鉛酸蓄電池好許多，單體電池的壽數也比較好，其大電流充放電特性也比鉛酸蓄電池好。可是鎳氫電池串連電池組的辦理疑問比較多，一旦發生過充電今后，就會構成單體電池隔板熔化的疑問，致使整組電池敏捷失效。所以，國產的鎳氫電池的要害技術疑問仍是充電器和電池管理體系的疑問，而這個疑問還沒有導致各個電池制造商和車廠滿足的重視。所以，鎳氫電池的展開收到很大的制約。

5、鋅空電池：鋅空電池以其比容大、污染小而著稱于世。電池選用換電的辦法，更新電池鋅板。替換一次鋅板能夠運用160公里到220公里。上海已經在全國率先垂范的展開了鋅空電池在電動自行車方面的運用，在全市設立了數十個換電網點，創始了鋅空電池在電動自行車方面運用的先河。可是，暫時還無法在上海以外的當地展開運用實驗，一起其運用本錢也是鉛酸蓄電池的數倍。若是，再進一步擴展其運用規模，有進一步下降運用本錢的可能性。

6、鎳鎘電池：鎳鎘電池的大電流特性比鎳氫電池好，其抗過充電特性也比鎳氫電池好，我國又是世界上鎳鎘電池的出產大國。一些人提出鎘污染的疑問，我國如今還在許多的向歐洲出口鎳鎘電池及其運用商品，歐洲到2006年才開端約束。據中央電視臺播映的音訊，神州五號仍是選用鎳鎘電池的。