1、發電效率高

燃料動力電池發電不受卡諾循環的限制。理論上，它的發電效率可達到85%～90%，但由于工作時各種極化的限制，目前燃料動力電池的能量轉化效率約為40%～60%。若實現熱電聯供，燃料的總利用率可高達80%以上。

2、環境污染小

燃料動力電池以天然氣等富氫氣體為燃料時，二氧化碳的排放量比熱機過程減少40%以上，這對緩解地球的溫室效應是十分重要的。另外，由于燃料動力電池的燃料氣在反應前必須脫硫，而且按電化學原理發電，沒有高溫燃燒過程，因此幾乎不排放氮和硫的氧化物，減輕了對大氣的污染。

3、比能量高

液氫燃料動力電池的比能量是鎳鎘電池的800倍，直接甲醇燃料動力電池的比能量比鋰離子電池（能量密度最高的充電電池）高10倍以上。目前，燃料動力電池的實際比能量盡管只有理論值的10%，但仍比一般電池的實際比能量高很多。

4、噪音低

燃料動力電池結構簡單，運動部件少，工作時噪聲很低。即使在11MW級的燃料動力電池發電廠附近，所測得的噪音也低于55dB。

5、易于建設

燃料動力電池結構簡單，運動部件少，工作時噪聲很低。即使在11MW級的燃料動力電池發電廠附近，所測得的噪音也低于55dB。

6、燃料范圍廣

關于燃料動力電池而言，只要含有氫原子的物質都可以作為燃料，例如天然氣、石油、煤炭等化石產物，或是沼氣、酒精、甲醇等，因此燃料動力電池非常符合能源多樣化的需求，可減緩主流能源的耗竭。

7、可靠性高

當燃料動力電池的負載有變動時，它會很快響應。無論處于額定功率以上過載運行或低于額定功率運行，它都能承受且效率變化不大。由于燃料動力電池的運行高度可靠，可作為各種應急電源和不間斷電源使用。