作為未來最理想的節能技術，燃料電池技術產業化以及商業化仍面臨不小的挑戰，燃料電池汽車商業化應用面臨的挑戰歸為以下幾類：

第一，標準類。燃料電池汽車有著長續航的優越特性，長續航就意味著要帶更多的氫氣，而目前在儲氫系統這塊70Mpa的氫系統標準亟待突破。

物流領域應用，對于終端用戶來說他們更在意運營成本，使用需要企業在氫氣的儲運方面加強技術研發。同時，燃料電池整車的相關標準也需要完善。

第二，資源類。

一是加氫站設施的建設，燃料電池汽車商業化應用離不開加氫站設施的配套建設，現階段加氫站無論是在審批和用地上都有極大的壓力。

二是燃料電池系統零部件自主化，實現燃料電池系統的關鍵零部件的自主開發和國產化，是降成本的一個關鍵路徑，這一塊需要供應鏈、零部件廠商來大力支持。

三是政策導向的市場壓力，當前新能源汽車市場是補貼驅動的市場，在沒有補貼或者補貼退坡以后，這個壓力其實也是必須承受的，也是必須有解決方案的。

第三，認知類。一是與氫氣安全相關的過度解讀，長期以來，由于公眾對于氫能缺乏足夠的了解，對氫燃料電池汽車的安全尚有疑慮，這也是氫燃料電池汽車產業目前難以快速發展的一大因素。

二是燃料電池技術的社會科普性，盡管燃料電池也叫“電池”，它是有別于儲能電池的，它實際上是一個發電裝置，它的能量其實存儲在儲氫系統里面的。三是全球技術路線的多元化，現階段燃料電池仍處于發育期，市場尚未形成規模，企業在技術路線上還不清晰。專家認為，未來燃料電池在技術路線上尚需確定1-2條非常明晰的技術路線。

作為新能源汽車產業的一支新秀，燃料電池汽車在技術研發、配套設施建設和大規模商業化應用上仍有很長的路要走。面對上述挑戰，需要企業、政府和社會共同參與，一起推進燃料電池汽車產業的發展。